大蛇丸是《火影忍者》中的重要角色之一，他死于自己设计的实验中。大蛇丸为了达到永生的目标，进行了各种禁忌的实验和自我改造，但终究失败了。
据故事揭示，大蛇丸在追求强大力量和永生的同时，使用了禁咒·封印之术和实验室中的禁忌技术。他把自己的灵魂封印在了巨大的蛇体中，并通过这种方式延长了自己的寿命。
然而，在与九尾妖狐的战斗中，大蛇丸被九尾妖狐的攻击重伤，身体分崩离析。最终，大蛇丸的灵魂和封印在蛇身中的身体都被彻底摧毁。
值得一提的是，大蛇丸死后并没有真正消失，他的意识和遗志被他的助手小蛇丸吸收，成为了小蛇丸的一部分。